无刷直流减速电机为了实现直流电机的无电刷换向，一般将电枢绕组放在定子上，把永磁磁钢放在转子上，与传统永磁直流减速电机的结构刚好相反。但仅这样做还不够，没有电刷的换流作用，用一般直流电源给定子各绕组供电，只能产生固定磁场，它不能与运动中的转子磁钢所产生的永磁磁场相互作用，来产生持续的单一方向的转矩，也就无法驱动转子连续转动。
无刷直流减速电机用位置检测器（有位置传感器或无位置传感器）、电子换向电路来取代有刷直流减速电机的电刷和换相器，即用电子换相取代机械换相，由位置传感器提供转子位置信号，经控制器逻辑处理后，控制电子换相电路换相，使定子绕组所产生的电枢磁场与转子磁钢产生的永磁磁场相互作用，产生持续不断的转矩，保证减速电机连续运转。
无刷直流减速电机的运行方式因减速电机本体的绕组型式不同而各异，多数无刷直流减速电机的定子绕组是三相绕组。